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              siRNA轉(zhuǎn)染標準操作流程

              更新時間:2025-07-16點擊次數(shù):1621

              以下是經(jīng)過優(yōu)化的 siRNA轉(zhuǎn)染標準操作流程,整合了關(guān)鍵參數(shù)優(yōu)化與避坑指南,適用于絕大多數(shù)哺乳動物細胞系(貼壁/懸浮),分為 實驗設(shè)計、操作步驟、質(zhì)控要點三部分:

              一、實驗設(shè)計關(guān)鍵點(轉(zhuǎn)染前必看)

              要素

              推薦方案

              避坑提示

              siRNA濃度

              終濃度10-50nM(預(yù)實驗梯度測試)

              100nM易致脫靶效應(yīng)

              細胞密度

              貼壁細胞:30-50%匯合度
              懸浮細胞:2-5×10?/mL

              過密毒性;過低效率

              轉(zhuǎn)染試劑

              Lipofectamine™ RNAiMAX(通用)
              jetPRIME®(原代/難轉(zhuǎn)細胞)

              避免含血清培養(yǎng)基稀釋試劑

              對照設(shè)置

              - 陰性對照:Scrambled siRNA
              - 陽性對照:GAPDH siRNA
              - 空白對照:僅轉(zhuǎn)染試劑

              缺一不可!












              二、標準操作流程(以24孔板為例)

               Day 0:細胞鋪板

              1. 消化細胞 用wanquan培養(yǎng)基 調(diào)整密度 每孔接種 0.5mL(貼壁細胞數(shù):5-8×10?;懸浮細胞數(shù):2×10?)  

              2. 37℃培養(yǎng)箱放置 16-24h(目標:轉(zhuǎn)染時匯合度≈40%)  

              關(guān)鍵細節(jié):  

              - siRNA工作液濃度 = 儲存濃度×30(例:20μM儲存液工作液終濃度≈33nM)  

              - 轉(zhuǎn)染試劑用量參考說明書(RNAiMAX通常 試劑:siRNA體積比=1:1)  

               Day 2:換液與檢測  

              1. 轉(zhuǎn)染后 6h 更換wanquan培養(yǎng)基(高毒性細胞如原代神經(jīng)元需4h內(nèi)換液)  

              2. 繼續(xù)培養(yǎng) 24-72h(基因沉默峰值時間需預(yù)實驗確定)  

               三、質(zhì)控關(guān)鍵步驟(決定成敗!)

               1. 轉(zhuǎn)染效率驗證(必做)

              - 方案1:轉(zhuǎn)染 FAM標記siRNA → 24h后熒光顯微鏡觀察(效率>80%合格)  

              - 方案2:共轉(zhuǎn)染 EGFP質(zhì)粒 計算綠色細胞占比(成本低但間接)  

               2. 沉默效果檢測

               3. 細胞毒性評估

              - MTT法:轉(zhuǎn)染后24h檢測,存活率應(yīng)>85%  

              - 形態(tài)觀察:懸浮細胞聚團、貼壁細胞空泡化提示毒性過強  

               四、高頻問題解決方案

              問題

              原因

              優(yōu)化方案

              效率低

              siRNA降解/試劑失效

              新解凍siRNA;更換轉(zhuǎn)染試劑批次

              細胞死亡率高

              復(fù)合物局部濃度過高

              轉(zhuǎn)染前混勻培養(yǎng)基;懸浮細胞用旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)法

              沉默效果不穩(wěn)定

              基因半衰期長

              延長檢測至72h;轉(zhuǎn)染兩次(間隔24h

              脫靶效應(yīng)

              siRNA種子區(qū)匹配非靶基因

              更換siRNA序列;使用化學(xué)修飾siRNA(如Stealth™

              五、特殊細胞優(yōu)化方案

              1. 原代細胞:  

                 - 轉(zhuǎn)染試劑:選 DharmaFECT™ Primary jetPRIME®  

                 - 方案:轉(zhuǎn)染前饑餓處理2h(無血清培養(yǎng)基)復(fù)合物孵育時間縮短至5min  

              2. 懸浮細胞:  

                 - 試劑:Neofect™ DNA/RNA Transfection Reagent  

                 - 步驟:離心收集細胞 重懸于復(fù)合物 → 24孔板每孔接種500μL(密度5×10?/mL)  

              3. 難轉(zhuǎn)細胞(如神經(jīng)元):  

                 - 專用試劑:NeuroFect™(佐劑提高穿透性)  

                 - 轉(zhuǎn)染后不換液 直接補等體積wanquan培養(yǎng)基  

              六、試劑耗材推薦表

              類型

              推薦產(chǎn)品

              適用場景

              通用轉(zhuǎn)染試劑

              Lipofectamine™ RNAiMAX

              293T/HeLa等常見細胞

              難轉(zhuǎn)細胞試劑

              jetPRIME®

              原代/干細胞/懸浮細胞

              陽性對照siRNA

              Silencer™ GAPDH siRNA

              體系驗證

              陰性對照

              AllStars Neg. siRNA

              排除非特異效應(yīng)

              > 數(shù)據(jù)標準:合格實驗需滿足——轉(zhuǎn)染效率>80% + 沉默效率>70% + 細胞存活>85%

              避雷總結(jié):  

              1. 勿用含抗生素或血清的培養(yǎng)基稀釋復(fù)合物(滅活試劑)  

              2. 轉(zhuǎn)染后換液時間寧早勿晚(超8h毒性飆升)  

              3. 凍存siRNA避免反復(fù)凍融>3次(分裝儲存-80℃)  

              按照此流程操作,可穩(wěn)定獲得可重復(fù)的基因沉默數(shù)據(jù)!

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